Jalur yang dilalui Trans Jogja

Jalur 7
Terminal Giwangan – Imogiri Timur (dalam Ringroad) – Pramuka – Perintis Kemerdekaan – Veteran – Simpang Empat Warungboto – Ki Penjawi – Rejowinangun – Simpang Empat Gedongkuning – Jalan Wonosari – Ringroad Timur – Simpang Empat Blok O – Janti – Babarsari – Seturan – Kledokan – Adisutjipto – Janti. Kemudian kembali melewati Jalan Janti dengan jalur yang sama hingga kembali ke Terminal Giwangan.

Jalur 11
Terminal Giwangan – Ringroad selatan – Jalan Imogiri Barat – Jalan Menukan – Jalan Parangtritis – MT Haryono – Sosrowijayan – Jalan Wahid Hasyim – Letjen Suprapto – Tentara Pelajar – Diponegoro – Tugu Pal Putih – AM. Sangaji – DR Sardjito – Bundaran UGM – Colombo – UNY – Gejayan – Ringroad Condongcatur – Terminal Condongcatur.

Jalur 9
Terminal Jombor – Jalan Magelang – Tentara Pelajar – Letjen Suprapto – Wahid Hasyim – Sosrowijayan – MT. Haryono – Parangtritis – Ringroad Selatan – Terminal Giwangan – Ringroad Selatan – Jalan Bantul – Sosrowijayan – Wahid Hasyim – Terminal Jombor.

Sumber : Dishub DIY.